Какой пол лучше сделать в квартире?

Однозначного "лучше" тут нет - выбор зависит от состояния основания, высоты потолков и назначения комнаты, но общий порядок оценки такой.

Если старый деревянный пол прогнил не полностью и лаги не тронуты гнилью, дешевле его перебрать: заменить сгнившие доски, обработать антисептиком, при необходимости добавить лаги, чтобы устранить скрип. Это сохраняет высоту потолков и обходится дешевле стяжки, но подходит только если основание сухое и без грибка.

Если решаете менять пол полностью, дальше выбор идёт не между стяжкой и наливным полом как альтернативами, а между двумя этапами одной технологии: сначала черновая стяжка (полусухая или цементно-песчаная толщиной от 30 мм) выравнивает основание и убирает перепады, а наливной пол - это финишный слой поверх стяжки толщиной 3-10 мм под тонкое покрытие вроде плитки или линолеума. Под ламинат наливной слой обязателен не всегда, если стяжка ровная в пределах 2 мм на 2 метра.

Для кухни и санузла отдавайте предпочтение стяжке с гидроизоляцией под ней - деревянный пол на лагах там боится влаги и со временем начинает гнить снова. Для спальни и гостиной, если высота потолков позволяет только минимальный подъём пола, дерево на лагах остаётся разумным вариантом: оно теплее бетона и не требует времени на просушку стяжки (цементно-песчаная стяжка толщиной 5 см сохнет около месяца из расчёта 1 мм в сутки).